Nicholas Flamel, sang Alchemyst, manusia abadi, kembali ke tanah kelahirannya: Paris, Prancis. Bersama Scathach dan si kembar, Sophie dan Josh Newman, kedatangan mereka disambut sang pakar kebohongan, manipulator handal, seorang lelaki Italia ambisius, Niccolo Machiavelli. Konon, ia jauh lebih berbahaya dari Dee.
Sementara itu Perenelle Flamel ditawan di Alcatraz, dalam penjagaan ketat sphinx. Tapi jika parenelle menyangka hanya sendirian di pulau kosong itu, ia salah. Alcatrazadalah pulau para hantu.
Di dua tempat terpisah, Paris dan Alcatraz, mereka harus berjuang mempertahankan dunia dari cengkeraman para Tetua Gelap. Berhasilkah mereka melawan makhluk-makhluk yang hanya muncul dalam mimpi buruk, sementara Flamel menua dengan cepat...